メッセージ・ウィンドウでは、IF/Prologのカレントbreakレベルと質問入力要求の'?-'プロンプトを表示します。また、システム状態に関する情報、例えば、ある質問が現在処理されているかとか、あるサブゴールウィンドウが現在動いているかどうかに関するメッセージを表示します。また、あるサブゴールウィンドウが画面上で見えない場合は、コマンドウィンドウのトップにあるRaise dialogボタンをクリックしてそのウィンドウを可視にすることができます。